基于“AIGC+連續(xù)進(jìn)化”設(shè)計(jì)蛋白,「域新說(shuō)生物」獲近千萬(wàn)元天使輪融資
6月13日消息,AI蛋白設(shè)計(jì)公司域新說(shuō)生物已完成近千萬(wàn)元天使輪融資,投資方為九合創(chuàng)投,本輪資金將用于技術(shù)研發(fā)和市場(chǎng)拓展。
域新說(shuō)生物成立于2022年,是一家專注于全新蛋白設(shè)計(jì)的公司,簡(jiǎn)單概括其技術(shù)和應(yīng)用,即利用AI進(jìn)行生物元件的設(shè)計(jì),并利用生物元件構(gòu)建基因電路的開(kāi)發(fā),通過(guò)設(shè)計(jì)基因電路使得菌株及催化酶可以進(jìn)行自然進(jìn)化,最終生成全新功能性蛋白。
公司研發(fā)了高精度算法來(lái)設(shè)計(jì)蛋白質(zhì)元件,并結(jié)合生物的“自然進(jìn)化”原理,將AI設(shè)計(jì)出的蛋白質(zhì)元件應(yīng)用于基因電路構(gòu)建。這使得微生物能夠自動(dòng)完成突變和進(jìn)化,生成具有全新功能的蛋白質(zhì)。這一技術(shù)主要應(yīng)用于合成生物學(xué)領(lǐng)域。
據(jù)域新說(shuō)生物創(chuàng)始人胡亦朗介紹,該技術(shù)的靈感來(lái)自與清華大學(xué)合成生物方向教授團(tuán)隊(duì)的合作交流。他們發(fā)現(xiàn)了一種將蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)化為“細(xì)胞可編程的指標(biāo)”的方法,即基因電路系統(tǒng)。這個(gè)系統(tǒng)非常適合優(yōu)化菌株和催化酶。隨后,團(tuán)隊(duì)利用高通量實(shí)驗(yàn)方法和高精度蛋白設(shè)計(jì)算法進(jìn)行了大量實(shí)驗(yàn)測(cè)試,最終將這兩套技術(shù)結(jié)合成為公司現(xiàn)有的技術(shù)平臺(tái)。
目前,公司將應(yīng)用范圍鎖定在合成生物場(chǎng)景。胡亦朗表示,相較于傳統(tǒng)定向進(jìn)化(非連續(xù)),設(shè)計(jì)基因電路進(jìn)行連續(xù)進(jìn)化具有更低成本、更深進(jìn)化規(guī)模和更短進(jìn)化周期?!霸诤铣缮镞@個(gè)熱門(mén)領(lǐng)域,這個(gè)方向具有巨大的開(kāi)發(fā)前景。具體體現(xiàn)在兩個(gè)層面:一是‘AIGC+連續(xù)進(jìn)化’的開(kāi)發(fā)路徑比較獨(dú)特;二是技術(shù)帶來(lái)的選品差異化。天然產(chǎn)物的菌株產(chǎn)量通常較低,利用當(dāng)前技術(shù)可以突破天然產(chǎn)物生產(chǎn)成本的瓶頸,實(shí)現(xiàn)商業(yè)化?!?
胡亦朗解釋到,目前行業(yè)內(nèi)構(gòu)建進(jìn)化的體系,一般利用的是自然界中存在的生物傳感器。而域新說(shuō)當(dāng)前利用AIGC算法來(lái)設(shè)計(jì)全新的生物元件可以在產(chǎn)品上可以出現(xiàn)更多的可能性。通過(guò)設(shè)計(jì)的蛋白與已經(jīng)構(gòu)建的技術(shù)平臺(tái),可以提高菌株的指定性質(zhì)(催化效率、轉(zhuǎn)化率、熱穩(wěn)定性等)。
據(jù)悉,在菌株優(yōu)化及催化酶優(yōu)化上,域新說(shuō)已分別在產(chǎn)率和催化效率上取得了不錯(cuò)的成果:在研管線有4條,其中對(duì)香豆酸的管線完成了3倍以上的產(chǎn)率提升,另外非天然氨基酸氨酰-tRNA合成酶完成了10倍以上的催化效率提升;團(tuán)隊(duì)還將AIGC算法應(yīng)用于催化酶設(shè)計(jì)上,成功驗(yàn)證4條全新設(shè)計(jì)的催化酶序列,同時(shí)熱穩(wěn)定性得到相應(yīng)提高。
胡亦朗介紹到,進(jìn)化技術(shù)應(yīng)用于合成生物學(xué)已經(jīng)有很長(zhǎng)一段時(shí)間了,利用AI設(shè)計(jì)蛋白在合成生物學(xué)領(lǐng)域是個(gè)非常經(jīng)典的落地場(chǎng)景。在此基礎(chǔ)上,域新說(shuō)正在探索基于蛋白設(shè)計(jì)+基因電路的更多應(yīng)用場(chǎng)景,利用現(xiàn)在構(gòu)建的蛋白、小分子、DNA的數(shù)據(jù)集和AIGC蛋白設(shè)計(jì)的思路,探索抗體藥物優(yōu)化、蛋白邏輯門(mén)、特種工具蛋白等應(yīng)用場(chǎng)景。
至于技術(shù)壁壘,他指出,高精度設(shè)計(jì)生物傳感器是一件相對(duì)來(lái)說(shuō)比較困難的事情,不同的蛋白功能優(yōu)化問(wèn)題需要用多種思路來(lái)完成設(shè)計(jì)。域新說(shuō)通過(guò)構(gòu)建多維度的蛋白-功能預(yù)測(cè)模型,同時(shí)利用不斷迭代的蛋白設(shè)計(jì)算法,從而實(shí)現(xiàn)基于多指標(biāo)的蛋白設(shè)計(jì)算法;同樣地,通過(guò)基因電路完成蛋白的進(jìn)化也需要細(xì)致的研究、驗(yàn)證與構(gòu)建,“這中間會(huì)涉及大量的‘know-how’及功能性蛋白元件的知識(shí)”;最后,兩者的理性設(shè)計(jì)最終組織成具體的實(shí)驗(yàn)方案是需要對(duì)這兩個(gè)指標(biāo)有充分理解的。目前域新說(shuō)在此均已實(shí)現(xiàn)了技術(shù)攻關(guān)。
團(tuán)隊(duì)方面,創(chuàng)始人胡亦朗畢業(yè)于牛津大學(xué)化學(xué)系,具有二代基因測(cè)序生信分析經(jīng)驗(yàn),并曾在貝殼如視事業(yè)部負(fù)責(zé)AI空間設(shè)計(jì)算法。他在化學(xué)、仿真、生信和AI算法等交叉領(lǐng)域擁有豐富的經(jīng)驗(yàn)和背景。創(chuàng)始團(tuán)隊(duì)均來(lái)自牛津大學(xué)。聯(lián)合創(chuàng)始人夏晉具有咨詢相關(guān)經(jīng)驗(yàn),并曾于英國(guó)GSK研發(fā)總部做過(guò)蛋白研究。聯(lián)合創(chuàng)始人王晨陽(yáng)畢業(yè)于牛津大學(xué)以及康奈爾大學(xué),曾工作于字節(jié)跳動(dòng)負(fù)責(zé)深度學(xué)習(xí)算法研發(fā)。科學(xué)顧問(wèn)則是來(lái)自清華大學(xué)的合成生物方向教授,他長(zhǎng)期致力于合成生物學(xué)領(lǐng)域研究。
胡亦朗透露,公司目前正在進(jìn)行核心管線的研發(fā)及商業(yè)化階段,目前已經(jīng)有生產(chǎn)廠商達(dá)成合作意向,公司也正處于業(yè)務(wù)拓展的節(jié)點(diǎn)上,期望同行業(yè)交流,將團(tuán)隊(duì)技術(shù)應(yīng)用于行業(yè),更好地服務(wù)于合成生物學(xué)行業(yè);另外公司也正在尋求新一輪的融資。
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